Bioinformatics Toolbox propose des algorithmes et des applications pour la création de pipelines bio-informatiques, le séquençage de nouvelle génération (NGS), l'analyse des biopuces, la spectrométrie de masse et l'ontologie génétique. Vous pouvez lire des données génomiques et protéomiques, les explorer avec l'application Genomics Viewer et les visualiser avec des cartes thermiques spatiales et des clustergrams. La toolbox (avec Statistics and Machine Learning Toolbox) propose des techniques de statistique, de régression, de classification et (avec Deep Learning Toolbox) de Deep Learning pour construire des pipelines d'analyse complets.

L'application Biopipeline Designer vous permet de créer de manière interactive des pipelines bio-informatiques pour l'analyse de données génomiques, localement ou dans le cloud. Vous pouvez utiliser une combinaison de blocs de pipeline bio-informatique prédéfinis qui intègrent des bibliothèques NGS éprouvées et des blocs personnalisés pour étendre les analyses en utilisant des outils communautaires. Vous pouvez créer un pipeline pour le prétraitement des lectures, les mettre en correspondance avec un génome de référence et effectuer des analyses statistiques, comme l'analyse de l'expression différentielle RNA-Seq ou l'analyse ChIP-Seq.